Dzięki nakładce separującej ciecz, czyszczenie systemu PTS bez demontażu (CIP/SIP) jest łatwe do osiągnięcia.
Ciecz myjąca jest zasysana do systemu, a jednocześnie pływak w pokrywie zapobiega przedostawaniu się cieczy do linii próżni.
W tym samym czasie czyszczenie obejmuje zarówno korpus PTS, jak i wąż przesyłowy, co stanowi dużą przewagę w porównaniu do dyszy rozpylającej.
System może być czyszczony w jednej linii wraz z innymi urządzeniami. Całość jest automatycznie suszona podciśnieniem, co pozwala uniknąć konieczność użycia gorącego powietrza.